Vellykket husdyrproduksjon avhenger vesentlig av fjøsmiljøet. Sammen med fôring er riktig hygiene en avgjørende faktor for optimal dyrehelse og vekst. Spesielt unge dyr krever et lavkim-miljø for å unngå tilbakevendende infeksjoner. Rengjøring og desinfeksjon med jevne mellomrom, samt bruk av hygienepulver, er effektive tiltak for å holde bakterietallet i fjøsen lavt.